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色谱仪柱温影响范第姆特方程中的Dgas和k值。适当提高柱温有利于提高k值，在相比率β不变的条件下则有利于改善柱效率；此外，提高柱温有利于减小固定液粘度和载气粘度，加快传质过程，故有利于加快分析速度。然而，温度也不宜过高，因为温度过高使Dgas变大而降低柱效率；再则温度过高使固定液流失严重，仪器也难以稳定，给操作带来很多不便。因此，一般宜选用较低的柱温。
柱温选择主要取决于样品性质。分析性气体和其他气态物质时，柱温一般控制在50℃以下；对沸点在300℃以下的物质，柱温往往控制在150℃以下；沸点大于300℃的物质，柱温较好能控制在200℃以下；高分子物质大多分析其裂解产物。若被分析样品的沸程较宽，则可采用程序升温分析。
此外，柱温还与固定相性质、固定相用量、载气流速等因素有关。通过选择适宜的固定相、适当减少固定液用量和加大载气流速等措施，则可达到降低柱温、加快分析速度之目的。
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