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微生物菌发酵处理技术就是把农作物秸秆通过粉碎、发酵、造粒等技术措施，使木质素被软化，粗蛋白、粗纤维、粗脂肪等降解成禽畜易于消化吸收的物质，同时发酵时还产生大量的菌体蛋白，发酵后变得软熟，香甜，造粒更增加了禽畜的适口性，粗蛋白、氨基酸平均水平会提高40.6%和95.8%,精氨酸、胱氨酸、组氨酸水平也有大幅度提高，糖、脂肪含量增加，并产生B、D、E 等维生素和生长因子，从而使禽畜采食量大增，生长加快。即减少粮食投入（每吨秸秆饲料相当于270千克粮食饲料的营养价值）节省了饲料成本，又增加了养殖者的收入。
农作物秸秆加工成微生物颗粒饲料具有很多优点：
① 制作过程中在机械自身压力下，温度可达80℃～105℃，能使饲料中的淀粉发生一定程度的熟化作用，产生一种浓香味，再加生物处理营养成份好、消化吸收率高，且饲料质地坚硬，符合猪、牛、羊的啮啃生物特性，提高了饲料的适口性，易于进食。
② 颗粒形成过程能使谷物、豆类中的胰酶抵制因子发生变性作用，减少对消化的不良影响，能杀灭各种寄生虫卵和其他病原微生物，减少各种寄生虫病及消化道系统疾病。
③ 秸秆生物颗粒饲料体积小、容量大。适口性好。营养成份好、饲喂方便，利用率高，便于控制饲喂量，节约饲料，干净卫生，减少污染 。尤其是养鱼，由于颗粒饲料在水中溶解很慢，不会被泥沙淹没，可减少浪费。
4、 秸秆生物饲料技术是继秸秆青贮、秸秆氨化之后的又一重大创新。它与其他技术相比具有制作时间短、周转快、供应及时投入成本低，产出效益高、防病治病、抗应激、净化环境、生产安全等特点.
秸秆养畜，在发达已经积累了许多成功的经验。美欧、日本、澳大利亚等国的畜牧业发展，很大程度上依靠的是用农作物秸秆生产出的颗粒饲料、生物秸秆蛋白饲料等。这些草转化肉类的比例为：美国73%、澳大利亚94%、日本81%，而我国不到9%。
秸秆养畜，在我国有着巨大潜力。我国农业秸秆量非常大，玉米秆、水稻秆、麦秆、油菜秆、花生禾、甘薯藤等每年产量7亿多吨，其中大部分被扔弃或胡乱烧掉，既浪费资源，也严重污染环境。与我们近邻的日本和韩国正是看中了这一庞大而廉价的资源，从我国秸秆颗粒和压块用于其养殖业的发展，2007年韩国从我国秸秆饲料约1000余万吨，而日本达到1500余万吨。
